水产养殖动物的疾病种类很多，如病毒性疾病、细菌性疾病、真菌性疾病、寄生虫性疾病、非寄生性疾病等，必须诊断准确，再选择治疗方法。主要有拌药饵投喂法、浸泡药浴法、注射法、涂抹法、全池泼洒法、挂篓挂袋法等，关于选择哪种方法要综合考虑以下因素：

根据患病动物的状况选择

患病后的水产养殖动物一般都较少摄食或不采食、游动缓慢或出现离群独游等现象。对于食欲下降的鱼类，即使在饲料中拌上药物投喂也很少起作用，只能是对尚能摄食的鱼类起作用，难以达到治疗的目的；另外，对于有摄食能力的鱼类，如果摄食的药物超量，还会造成药害；对于不能摄食的鱼类则根本不起作用。而未被摄食的药饵，会不断地释放养殖水体中，对养殖环境造成不良影响。因此，采用投喂药饵时要注意患病水产养殖动物的摄食能力。

根据病原的特性选择

水产养殖动物的病原体有病毒、细菌、寄生虫等多种类型，对于不同类型的病原体应采用不同的药物。因此，必须在确定病检的基础上，对病种做出正确的诊断后选择药物。

对于病毒病，目前还没有有效的治疗药物，而对患病毒病的鱼类用药，主要是为了控制病原性细菌对其的二次感染。

对于细菌性水产养殖动物疾病，一般采用抗生素药物进行治疗，在这种情况下，还需要注意患病鱼类是局部感染还是全身性感染，由此来选择给药方式。

由寄生虫引起的各种疾病，如果鱼的体表寄生大量寄生虫性病原体，可采用药浴、全池泼洒等外用药治疗，而对于寄生在鱼消化道内的寄生虫引起的疾病，则必须投喂药饵才能起到良好效果。

使用者要认真阅读产品说明书，有的剂型药物在消化道内不容易吸收，而较容易通过鱼鳃吸收。